Lemonsoft Logistiikkaan kuuluvat Varastokirjanpito, Myyntitilaukset, Ostotilaukset, Poikkeamien käsittely (reklamaatiot), Toimittajahinnastojen päivitys, Huoltotyöt, Intrastat,Vuokraustoiminnot ja Kokolajitelmat. Ohjelmistoja voidaan käyttää erillisinä tuotteina tai osana integroitua Lemonsoft kokonaisratkaisua.
Lemonsoft Varastokirjanpito 
on varastonhallintaan tarkoitettu ohjelma, jossa myös tukku- ja teollisuustoimialojen erityspiirteet on huomioitu. Lemonsoft-varastokirjanpito palvelee myyntiä, ostoa ja tuotantoa.
Perustietoja on runsaasti. Voit määritellä tuotteelle useita toimittajia, joilla jokaisella voi olla oma tuotekoodi. Yksikkökäsittelyssä tuotteella voi olla hintayksikkö, varastoyksikkö, myyntiyksikkö ja ostoyksikkö. Ohjelmassa mukana myös monivarasto-ominaisuus. Lisäksi ohjelma osaa muodostaa kaupanalan EAN-koodit juoksevasti annettujen perustietojen perusteella. Tilaustenkäsittely, laskutus, kassa ja tuotanto kirjaavat automaattisesti varastotapahtumia. Myös sarja- ja eränumeroiden käsittely on tuettu.
Tuoterakenteen avulla kerrotaan mistä tuotteista päätason tuote koostu, ja tuoterakenteita voi olla monentyyppisiä. Tuoterakenteen tasojen määrää ei ole rajoitettu ja tuotekonfiguraattorin avulla voidaan muodostaa rakenne ohjatusti konfigurointi-velhon avulla.
Kustannuslaskennan avulla voit laskea monimutkaistenkin tuotteiden omakustannushinnan nopeasti ja luotettavasti. Laskennan tulokset voidaan siirtää suoraan tarjousriville ja myynti- sekä omakustannushinnan voi päivittää nimikekorttiin.
Valmistuskirjauksen avulla kirjataan valmistettavien tuotteiden määrät varastoon ja poistetaan kuluneet puolivalmisteet ja raaka-aineet.
Inventointi voidaan tehdä usealla eri tavalla ja se on prosessi, jota ohjelma ohjaa. Inventointi pohja voidaan viedä myös Exceliin ja tuoda sitten inventointisaldot takaisin.
Lemonsoft Myyntitilaukset
on monipuolinen myyntitilausten ja toimitusten hallintaan tarkoitettu ohjelma. Myyntitilaukset kirjatessa kaikki oleellinen tieto on näkyvissä samaan aikaan ja tilausten kirjaaminen on nopeaa. Suorakirjausten lisäksi myyntitilaukset voidaan lukea edi/ovt sanomasta, erilaisista toimittajaporttaaleista (mm. SAP) tai kauppapaikasta, joka on integroitu Lemonsoftiin. Ostot tai tuotantokirjaukset voidaan tehdä suoraan tilaukselta.
Myyntitilauksesta voidaan tulostaa normaalit lomakkeet sekä tuotetarrat ja työmääräimen. Myyntitilauksen toimitus tukee osa- ja jälkitoimituksia ja keräily voidaan tehdä tiedonkeruupäätteillä. Toimituksen yhteydessä voidaan tulostaa lähetteet, tarrat ja rahtikirjat, ja tilaus voidaan samanaikaisesti myös laskuttaa.
Myyntitilauskeskus on paikka, jossa hallitset toimittamattomia ja laskuttamattomia myyntitilauksia.
Lemonsoft Ostotilaukset
ohjelman avulla kirjaat ja seuraat ostoja tehokkaasti. Ostotilaukset voidaan kirjata suoraan, myyntitilaukselta tai ostot voidaan tehdä ostotyökalun avulla. Ostotyökalu on monipuolinen työkalu ostamiseen, ja sen avulla voi suunnitella määritellyn ajanjakson ostoja tai ostaa suoraan tietylle työlle.
Ostotilauskeskuksen avulla voidaan valvoa saapumattomia ostotilauksia. Keskuksesta voidaan myös tulostaa ostotilaus ja kirjata saapumiset. Saapumisen yhteydessä päivitetään haluttaessa varastosaldot ja tuotteen hinnat, ja voidaan jyvittää rahti ym. kulut ostohintaan.